- NCBI, Genbank, Entrez
- Blast
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov
- Uebersetzen DNA--> Protein
- blastx: uebersetzt und alignt automatisch
- Genbank
- Genbank: Zugriff auf Nukleotidsequencen
- enthaelt: kurze Sequenzbeschreibung, wissenschaftliche Namen
und Organismustaxa, bibliografische Referenzen
- Entrez
- enthaelt: Genomdaten, Sequenzen, zu bestimmten Genen
- Ensembl
- vollstaendige Gensets (hauptsaechlich Mammalia)
- genomweite Bestimmung der Transkripte, regulatorischer Merkmale, non-coding RNAs, . . .
- Beziehungen zwischen Genen und Genomen darstellbar
- Prosite
- Datenbank fuer: Protein Domaenen, Protein Familien, Protein Funktionen, Profile und Patternsuche in Proteinfragmenten
- Expasy
- Tools zur Sequenzanalye und zur Proteomik zur Verfuegung gestellt
z.B. BLAST, ScanProsite, SWISS-MODEL, GlycanMass, FindMod
- UniProt
- Informationen zu: Proteinstruktur, Proteinfunktion, Querverweise zu anderen themenrelevanten Datenbanken
- PDB
- enthaelt Proteindaten:
3D-Koordinaten, Ligandenchemie, Sequenzen, Informationen über die Experimente (genutzte Methode zur Ermittlung der Daten)
- Tools: Ramachandran Plot, RasMol, Jmol, WebMol
- Brenda Enzymdatenbank
-Daten zu Enzymen
- Erklaerung der EC Nummern
- Sequence Suche, Genome Explorer, Substructure Search (Protein anhand chem. Struktur des Liganden finden)
- KEGG
- enthaelt Strukturen von Biomolekülen, Genen, Stoffwechselwegen, Reaktionsgleichungen und Medikamenten
- PATHWAY-Mapping: Abbilden von Genomen auf vorgegebene Netzwerke
- BRITE-Mapping: Einordnen biologischer Objekte in funktionelle Hierarchien
- BioCyc
- Sammlung von (momentan) 507 Organismus-spezifischen Datenbanken
- Ecocyc: Literaturbasierte Sammlung zum E. coli Genom
- MetaCyc: Sammlung von Stoffwechselwegen & deren Enzyme
- PathwayTools
- Handouts auf Common